業績（Publications）

📘 学術論文

🔬 最新の研究（2023年〜2025年）

• Sakai, Y, K. Matoba, T. Kotani 他（2025年）
  「Mechanism of bridge-type phospholipid transfer by Atg2 for autophagosome biogenesis」
  bioRxiv
• Zi Yang, S.R. Yoshii, Sakai, Y 他（2024年）
  「Autophagy adaptors mediate Parkin-dependent mitophagy by forming sheet-like liquid condensates」
  The EMBO Journal
• K. Hibino, Sakai, Y 他（2024年）
  「Single-nucleosome imaging unveils that condensins and nucleosome-nucleosome interactions differentially constrain chromatin to organize mitotic chromosomes」
  Nature Communications, 15(1), 7152
• Sakai, Y, S. Takahashi 他（2024年）
  「Experimental determination and mathematical modeling of standard shapes of forming autophagosomes」
  Nature Communications, 15(1), 91
• T. Kotani, Sakai, Y 他（2023年）
  「A mechanism that ensures non-selective cytoplasm degradation by autophagy」
  Nature Communications, 14(1), 5815
• S. Shinoda, Sakai, Y 他（2023年）
  「Syntaxin 17 recruitment to mature autophagosomes is temporally regulated by PI4P accumulation」
  eLife

🧪 数理モデル・染色体形成（2020年〜2022年）

• Sakai, Y（2022年）
  「Mathematical Model of Membrane Deformation Dynamics in Autophagosome Formation」
  Seibutsu Butsuri, 62(1), 50–52
• Sakai, Y, I. Koyama-Honda 他（2020年）
  「Modeling membrane morphological change during autophagosome formation」
  iScience, 23(9), 101466
• Sakai, Y, I. Koyama-Honda（2020年）
  「オートファゴソーム形成の物理モデル」
  医学のあゆみ, 272(9), 758–762

🧬 染色体・コンデンシン関連（2016年〜2019年）

• Sakai, Y, T. Hirano, M. Tachikawa（2019年）
  「Molecular Dynamics Simulations of Condensin-Mediated Mitotic Chromosome Assembly」
  Methods in Molecular Biology, pp. 319–334
• Sakai, Y, A. Mochizuki 他（2018年）
  「Modeling the functions of condensin in chromosome shaping and segregation」
  PLOS Computational Biology, 14(6), e1006152
• Sakai, Y, M. Tachikawa, A. Mochizuki（2016年）
  「Controlling segregation speed of entangled polymers by the shapes」
  Physical Review E, 94(4), 042403

⚛️ QCD・理論物理関連（2007年〜2015年）

• • T. Makiyama, Sakai, Y 他（2015年）
    「Phase structure of two-color QCD at real and imaginary chemical potentials」
    Physical Review D, 93(1)
  • H. Kouno, T. Makiyama, T. Sasaki, Sakai, Y, M. Yahiro（2013年）
    「Confinement and Z₃ symmetry in three-flavor QCD」
    Journal of Physics G, 40(9), 095003
  • Sakai, Y, H. Kouno 他（2013年）
    「Quark-gluon thermodynamics with the ℤ₃ symmetry」
    Journal of Physics: Conference Series, 432(1), 012029
  • T. Sasaki, J. Takahashi, Sakai, Y 他（2012年）
    「Model approach to the sign problem on lattice QCD with theta vacuum」
    Proceedings of Science, Part F130497
  • H. Kouno, Sakai, Y 他（2012年）
    「Quark–gluon thermodynamics with the Zₙc symmetry」
    Journal of Physics G, 39(8), 085010
  • Sakai, Y, H. Kouno 他（2012年）
    「The quarkynic phase and the Zₙc symmetry」
    Physics Letters B, 718(1), 130–135
  • Sakai, Y, T. Sasaki 他（2012年）
    「Entanglement between deconfinement transition and chiral symmetry restoration」
    素粒子論研究, 119(4), F38–F40